果树烂根病主要发生在地表和地面以下，地上部表现主要为生长缓慢、树势衰弱、叶小而黄、展叶迟而落叶早等。因此，发现有类似情况时，应挖开土壤检查，诊断病害种类，并根据病害种类采取相应治疗措施，做到早发现、早治疗。
发现病树后，首先要在病树周围挖封锁沟，避免病树根与健树根的接触，防止病区扩大。一般沟深50~60厘米，宽40~50厘米。局部根皮腐烂者，用刀彻底刮除病组织;整条根腐烂者，要从根基部锯除，并向下追寻，直至将病根彻底挖出。病根、病皮要仔细收集烧毁，不能随便抛弃.在处理过程中要特别注意保护未发病或局部发病的根，不要轻易切断或损伤。处理病根后，还要注意保护病根处理伤口，防止复发。一般可用2°~3°Be石硫合剂涂抹伤口。病树抬疗后，要加强栽培管理，促进树势恢复。如根部桥接、嫁接新根、叶面喷肥、树上重剪等。
根朽病轻病树也可采取直接灌药的方法进行治疗。方法为:在树冠下每隔2O厘米左右打一孔，孔径3厘米左右，孔深30-50匣米，每孔灌入200倍福尔马林液100毫升，灌药后用土封闭灌药孔，进行土壤熏蒸，一般2-3个月后病根即可治愈。紫纹羽病、白纹羽病和白绢病在病根处理和保护伤口的同时，还必须对树穴土壤进行处理，如换土、树穴灌药消毒等。紫纹羽病可用70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液或50%代森铵水剂500倍液浇灌;白纹羽病可用70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液浇灌;白绢病可用50%代森铵水剂500~800倍液浇灌。用药量因树冠大小而异，7-8年生幼树，每株用药液50-100公斤;15年左右生大树，每株用药液100-200公斤;25年生老树，每株用药液200-300公斤，另外，白纹羽病和白绢病也可用毒土处理树穴或病树周围，一般常用80%五氯酚钠粉剂30~50倍药土或75%五氯硝基苯30~50倍药土。药土用量一般大树为15-25公斤