1、主要病虫害
红蜘蛛、黄蜘蛛、矢尖蚧、花蕾蛆、潜叶蛾、疮痂病、炭疽病。
2、防治技术
（1）红、黄蜘蛛
防治时间：2月到6月上旬和9月至10月。
防治办法：
1、冬季清园喷药，消灭越冬虫卵，压低越冬虫口基数。
2、在柠檬园内合理间种藿香蓟、紫苏、豆类等作物，改善果园生态环境，以利天敌的生存和繁殖，达到生物控制红黄蜘蛛的目的。
3、药剂防治：①苦参碱600倍液。②克螨特2000－3300倍液。③果圣乳油1000倍液。④25%皂素烟碱300倍液。⑤0.3％印楝素1000－1500倍液。⑥硫磺悬浮剂200－300倍液。⑦0.3-0.5波美度的石硫合剂。⑧尼索朗1000－2000倍液。⑨哒螨灵1500－2000倍液。⑩四螨嗪2000－3000倍液
（2）花蕾蛆
防治时间：3月到4月
防治办法：
1、冬春翻耕土壤，能杀死部份越冬虫蛹。
2、花蕾现白前一周，地面施药。
3、及时摘除被害花蕾集中烧毁，减少虫口基数。
4、树冠喷药：①BT乳油；②0.26％绿宝清600倍液；③乐斯本乳油1000－1500倍液。
（3）锈壁虱
防治时间：6月至8月
防治办法：
1、在套袋前施一次药剂。
2、加强果园检查。若园内发现第一个灰果（或黑果）时立即施药防治。
3、药剂种类：① 0.5波美度的石硫合剂。②硫磺悬浮剂200－300倍液。③果圣乳油1000倍液。④皂素烟碱300倍液。⑤0.3％印楝素1000－1500倍液。⑤乐斯本乳油1000－1500倍液。
（4）矢尖疥
防治时间：5-6月防治第一代、7月防治第二代、9-10月防治第三代。
防治办法：
1、冬季清园，剪去为害枝，压低越冬基数。
2、药剂防治：①95%机油乳剂；②松脂合剂15-20倍液；③25％皂素烟碱300倍液；④果圣乳油1000倍液；⑤0.3-0.5波美度的石硫合剂。
（5）潜叶蛾
防治时间：秋梢抽发期
防治办法：
1、抹除夏梢，集中放晚夏梢和秋梢。
2、药剂防治：① BT乳剂；②0.26％绿宝清600倍液。
（6）疮痂病 炭疽病
防治时间：春梢发芽一粒米（0.5厘米）防治叶疮痂 ，谢花2/3防治果疮痂，幼果期、夏秋梢抽发期防炭疽病
防治办法：
1、开沟排湿，翻耕除草。
2、除尽地面的枯枝、病枝、病果、叶，并把残留在树上的枯枝、病枝、病果剪下集中烧毁或深理。
3、药剂防治时间。应在2月底3月上旬普遍施药防治叶疮痂病，在4月下旬谢花2/3时再施药防治，以后每隔10-15天施药一次，连续3-4次。在施药防治的同时，可结合施用叶面肥，以增强树体抗逆能力，达到保花保果提高药效的作用。
4、药剂种类：①波尔多液；②0.3-0.5波美度的石硫合剂；③80%的大生M-45可湿性粉剂600-800倍液；④代森锰锌600-800倍液；⑤施保克1000倍液； ⑥硫磺悬浮剂200－300倍液；⑦腈菌唑2000倍液；⑧梧宁霉素1000倍液；⑨阿米西达1000倍液。
（7）流胶病
防治时间：发病即防（3-11月）
防治办法：
1、使用N、P、K及微量元素齐全的柠檬专用配方肥。
2、选用抗病砧木，如脱毒后的枳砧嫁接苗。
3、加强对天牛、吉丁虫及树干病害的防治；避免机械损伤、日灼和冻伤。
4、治疗：对发病部位及周围用快刀刮除病部树皮，刮干净后再进行纵刻，间隔1厘米1刀、深至木质部。用九二O适量或20单位的多效霉素或铜锰合剂涂于刻伤处，每隔7-10天一次，直至涂好为止。
备注：
1、在防治病虫害时，禁止使用国家明文禁止的剧毒、高毒、高残，不易分解的农药、激素等（参照中华人民共和国农业部第199号公告和柠檬进口国农残限量标准）。
2、在防治病虫时，一定要避免大风、下雨。
3、每种药剂一年只能施用一次。
4、采果前一个月禁止施用化学农药。