柑桔的根系生长在土壤中，但地下的土壤变化大多为我们果农所不能目睹，往往被果农所忽视，而一般来说，土质疏松、有机质丰富、既通气又能保持水分的土壤才能适应柑橘正常生长发育。土壤管理就是通过深翻扩穴、中耕除草、培土覆盖、种植绿肥等技术措施，为果树生长发育提供适宜的肥、热、水、气等土壤条件，土壤的管理决定柑桔果树的生长良好与否，直接影响柑杼的产量和品质。我国南方丘陵山地柑橘果园普遍存在“瘠、酸、粘”等特点，加强土壤管理尤为必要。土壤改良的主要措施：
（一）深翻扩穴，改良土壤
山地幼树在定植后几年内，应继续在定植沟或定植穴外进行深度相等或更深的扩穴改土，以利根系生长，成龄橘园土壤紧密板结，地力衰退，根系衰老，改土是确保树势能及时恢复，培育强大的根系，扩大树冠，增加有效枝数和总叶数的重要措施。
深翻方式可有全园深翻和局部深翻。全园深翻即在树冠外的土壤全部深翻，而对树冠下只中耕。局部深翻，即今年深翻株间土壤，明年深翻行间土壤，逐年扩大深翻范围，方法是在每年果实采收前后用环状法或对称沟法等，选晴天围绕树体将原植树穴位逐年扩大，使扩穴部分与上一年的老穴位挖通，沟与沟之间不能留隔墙，并将扩穴部位的细根和侧根斩断1/4～1/3左右，之后让其晒2～3天。
深翻必须结合施有机肥，才能达到改良土壤，提高土壤肥力的目的。有机肥可用栏肥、饼肥、堆肥、河塘泥、处理过的垃圾等。每立方米土壤加50～150kg有机肥，与土壤分3～4层压入土中，再施畜粪杂肥，效果更好。对酸性土每50kg有机肥加入0.5～1kg石灰或钙镁磷肥，可调节土壤pH。
若遇冬旱，则在施足基肥后，再每隔一个星期再施1次腐熟的人畜粪尿水，以促进发根。树势不旺和秋旱严重时不必断根。
（二）中耕除草，培土覆盖
桔园应适时进行中耕除草和疏松表土，防止土壤水分蒸发，促进有机质分解，增强土壤保水保肥性能，并能更新根系，促进萌生新根，增强根系吸收机能。浙西南热量条件好，雨水充足，杂草生长快，易消耗土壤养分，且为柑桔病虫害提供潜伏场地，为此应加强中耕除草和疏松表土。
中耕：全年中耕4～8次。～般雨后适时中耕，使土壤疏松，有助于形成土壤团粒结构，减少水分蒸发，降雨时有利于水分渗入土内，减少地表水分流失。大雨暴雨前不宜中耕，否则易造成表土流失。为了防止水土流失，采用种植绿肥与中耕相结合的办法较为合理。
半免耕：即果园株间中耕，行间生草或间作绿肥不中耕，有利于保持水土，改善土壤结构，节省劳力。
为补充被雨水流失的果园表层土壤，应对桔树根系进行培土，培土可以提高橘树的防寒、防暑、抗旱能力。培土一般在冬季霜冻来之前结合施肥进行，可有效地避免根基部和主干遭受冻害。培土应按土质而定，黏土客沙土，沙土客黏土，果园附近选择肥沃的土壤培土，既可增加耕作层的厚度，也能起到施肥的作用，对柑橘生长有良好的效果。培土时间，宜在冬季，培土前先中耕松土，然后客入山土、沙泥、塘泥等，一般培土厚度10～15cm，每隔1～2年培土一次，大面积客土困难，可分期分批培土。如果结合地膜覆盖，膜边用土压实压严，以防热量散失和被风吹起。低温过后，应及时把根颈以上的培土扒开，以防烂根及病虫为害。此外在采果后，也可在柑橘园中培入草皮土、塘泥、土杂肥等，以加厚土层，护根防寒。
（三）果园间作与生草，增加土壤肥力
一般土壤每年约消耗2％的腐殖质，及时补充有机质是维持和提高桔园地力的必要措施。经济有效的办法是套种绿肥，幼年树间隙应尽可能地栽种绿肥，每年深翻以满足土壤改良和每年增施有机质的需要。山地桔园土壤瘠薄，有机质缺乏，冲刷严重，更须间种绿肥，改善土壤理化性，提高土壤肥力，以园养园，绿肥覆盖地面，夏季可防止冲刷，降低土温，增加空气湿度和抑制杂草。树冠下不间作绿肥，幼树留出一米的树盘不种绿肥，果园不间作高干及缠绕性作物，如玉米，豇豆等。
未进行间作的成年果园可考虑进行生草栽培，即果园内选留良性杂草或种植牧草，覆盖果园地表，其实质是一种土壤管理方法，不仅省工而且有水土保持效果，并可增加土壤中有机质、改善果园生态环境。生草栽培的关键是选择适宜的草种。按柑桔根系生长的特点，6～9月是旺长时期，理想的草种是10月发芽，5月停止生长，6月下旬草枯而为敷草。生草栽培对土壤具有保护作用，可防止水土流失，增加土壤有机质，促进土壤团粒结构的形成，增强土壤通透性，节省耕耘劳力。如藿香蓟，4月上旬播种，一年可多次收割，每667平方米产绿肥可达4000kg以上，又有减轻柑桔螨类等的效果。