2.1 通过嫁接杂交培育新种类型或新品种达尔文首次提出嫁接杂种一词，并列举了亚当金雀花等许多嫁接杂种的实例。米丘林创造了获得嫁接杂种的新方法——蒙导法，并由此培育了梨、苹果等嫁接杂种。随着研究的不断深入，证明嫁接杂交的概念是科学的，嫁接杂种及其生物学机制是存在的。采用的嫁接杂交方法不同，会产生不同类型的嫁接杂种。
2.1.1 嫁接嵌合体 主要由砧木和接穗接合部位愈伤组织产生的新梢培育而成。两种嫁接成份不同的组织排列能产生多种多样的表现型，可望培育出外皮抗病虫，内部营养丰富，或者表皮色泽艳丽而果肉味美质优的品种。将马铃薯与番茄嫁接获得红皮的马铃薯。至于观赏园艺植物嫁接嵌合体的稀、奇、怪、异，别具情趣，能大大提高观赏价值。目前在柑桔、杨树、山茶花等植物中产生了许多嫁接嵌合体，有不少已培育成为优良的品种。
2.1.2 蒙导杂种 在果树、茄科蔬菜、棉花、大豆等植物中采用蒙导法已产生了许多蒙导杂种（即过去所说的无性杂种）。采用蒙导法进行嫁接杂交时，如果将砧木作为蒙导者，接穗作为被蒙导者，那么就一定要求接穗取自幼龄杂种实生苗，而砧木在阶段性上必须是老龄的，并且嫁接后要不断摘除接穗的叶片，而使砧木的枝叶大量生长。这与一般的嫁接繁殖方法根本不同，甚至是完全相反的。现在研究表明，采用蒙导法进行嫁接杂交的机理主要是遗传转化，即砧木中的遗传物质转移并整合到接穗生长点细胞的染色体组中，这与“外源DNA导入植物技术”、L.B.技术的机理是相似的。这意味着采用嫁接杂交不仅能培育出丰富多彩的嫁接嵌合体，还能培育出类似转基因植物的蒙导杂种，且方法简单实用，是一条不容忽视的育种途径。
2.2 作为有性杂交育种的辅助手段
2.2.1 克服远缘杂交中存在的困难 在植物远缘杂交中，往往存在着远缘杂交不亲和性和杂种不育性的困难。当两种植物用有性杂交不能成功时，可采用米丘林创造的预先无性接近法，即先把两种植物嫁接在一起，然后再进行有性杂交，就容易取得成功。采用这种方法已获得了许多植物的远缘杂种。当获得的远缘杂种幼苗极度虚弱，难以发育成为新个体时，可采用幼苗期靠接或高接的方法，提高远缘杂种幼苗的成活率。
2.2.2 缩短有性杂交育种周期 多年生植物通过有性杂交获得的杂种实生苗往往具有较长的童期，因此育成一个品种往往需要十几年乃至几十年的时间，采用高接或矮化砧嫁接技术，可缩短这个过程。如美国育种家布尔班克在一棵大梨树上嫁接了上千个梨杂种苗接穗，既缩短了育种时间，又节省了土地。
2.3 嫁接技术在芽变选种中的应用 当人们发现植物产生优良芽变时，就可将发生变异的枝或芽取下，采用无性繁殖的方法，按选种程序进行品种选育，这就是通常所说的芽变选种。开始发现变异时，首先要鉴定是属于遗传物质突变，还是属于环境影响的饰变，最可靠的鉴定方法之一就是高接。即把那些可能是优良芽变的枝条，高接在同种植物的树冠上，变异性状如果能稳定地传递给由高接枝条所形成的树体，则为芽变，经进一步选育，有可能成为芽变品种。
2.4 嫁接技术在种质资源保存中的应用 种质资源是植物育种的基础。对于许多植物来说，传统的保存方法是种植法，占地多，所需管理费用较大。利用矮化砧进行多头嫁接，或在一株砧木上高接许多品种，可以经济利用土地，并降低管理费用。